Hva er PubMed?

PubMed er en gratis søke-database for bl.a. vitenskapelige artikler innen medisin og helse. Du kan altså fritt søke og lese sammendragene, men fulltekstartikler er ikke alltid tilgjengelige uten abonnement eller institusjonell tilgang:

For tilgang til artikler NIH betaler for, bruk denne lenken:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?holding=inonihlib&otool=bibsys
Husk å være pålogget VPN-klienten hvis du er utenfor skolens nettverk ellers får du ikke åpnet artiklene vi har tilgang til.

Verdt å vite!
Biblioteket gir undervisning i litteratursøk i PubMed fra 2. års bachelor t.om. master. Det vil stå i timeplanen din.
Har du spørsmål om PubMed? Kontakt Anne Grete Gabrielsen på epost annegg@nih.no

Nyttige lenker:

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/

https://ntnu-no.libguides.com/PubMedguide

Følg pilene for stegvis veiledning i PubMed-søk:

Fra problemstilling til søkestrategi

Eksempel på en enkel problemformulering:

Hvordan påvirker fysisk aktivitet ungdommers psykiske helse?

Finn nøkkelordene:
fysisk aktivitet, ungdom, psykisk helse
Oversett til engelsk, f.eks.:
physical activity, adolescent, mental health
Test først med et enkelt søk der du ramser opp nøkkelordene slik du har oversatt dem:

physical activity adolescent mental health

Dette gir treff på artikler som inneholder alle tre ordene og et test-søk gjør at du

får færre, men mer relevante treff
kan finne én eller to gode artikler raskt
ser hvilke begreper forskere faktisk bruker (samme tema omtales ofte med ulike ord). Søker du f.eks. bare på adolescent, kan du gå glipp av relevante artikler der det i stedet står youth eller teenagers.

Lag deg en søkeoversikt i tabell

Når du er ferdig med testsøket og fått flere relevante ord og synonymer, er det lurt å strukturere søket mer systematisk. Lag gjerne en søkeoversikt – f.eks. i en tabell i Word – hvor du:

Legger til nye ord eller uttrykk du finner
Fjerner begreper som viser seg å gi irrelevante treff
Noterer hvilke kombinasjoner som ga de beste resultatene

Slik får du et dynamisk verktøy som du kan oppdatere løpende etter hvert som du finner flere relevante artikler som igjen gir deg nye søkeord.

Eksempel på en tabell med søkeord
3 tema	synonymer til hvert tema
physical activity	"physical activity" exercise workout "physical training" "physical fitness"
adolescent	adolescent teen* youth young girl* boy student* juvenile
mental health	"mental health" depression well-being "psychological health" anxiety

Fra søkeoversikt (tabell) til en søkestreng

Eksempel på en tabell med søkeord
3 tema	synonymer til hvert tema
physical activity	"physical activity" exercise workout "physical training" "physical fitness"
adolescent	adolescent teen* youth young girl* boy student* juvenile
mental health	"mental health" depression well-being "psychological health" anxiety

For å lage en søkestreng må du ta i bruk bolske operatorer (AND, OR, og noen ganger NOT). Når du har synonymer, kombinerer du dem slik:

Parenteser grupperer synonymer. I vårt eksempel er det 3 tema, dermed må du ha 3 parentes-par
OR brukes mellom synonymer. Du vil enten ha det ene ordet eller det andre, eller det tredje, eller alle, osv.
AND brukes mellom temaene. Du vil jo at alle artiklene skal inneholde minst 1 ord fra hvert tema.

I vårt eksempel blir da søkestrengen slik:

("physical activity" OR exercise OR workout OR "physical training" OR "physical fitness") AND (adolescent OR teen* OR youth OR young OR girl* OR boy OR student* OR juvenile) AND ("mental health" OR depression OR well-being OR "psychological health" OR anxiety)

Les om hermetegn rundt fraser (to eller flere ord som hører sammen) og bruk av trunkering (*) i Verktøykassas del om Søk smart - søketeknikker

Start søket i PubMed

Lim søkestrengen din inn i PubMeds søkefelt og klikk på search.

Visuell framstilling av søket i PubMed:

Skjermbilde fra PubMed med cite-funksjonen åpnet. APA-referanse vises i et eget vindu.

Når du gjennomfører et søk, kan du ofte få mange treff. Det betyr ikke at søket er dårlig – det kan heller være et tegn på at temaet er godt forsket på.

Avgrens søket ditt

Unngå å bruke filterfunksjonene i venstre marg når du skal avgrense søket!

Bruker du det kan det føre til at de nyeste artiklene ikke vises. Det er likevel trygt å bruke filter for språk og/eller publiseringsår.

En smartere måte å avgrense på er å legge til avgrensningsord. F.eks. om du kun vil se randomiserte kontrollerte studier (RCTs), kan du utvide søkestrengen med en ny parentes:

("randomised controlled trial" OR RCT)

Da vil din nye søkestreng se slik ut:

("physical activity" OR exercise OR workout OR "physical training" OR "physical fitness") AND (adolescent OR teen* OR youth OR young OR girl* OR boy OR student* OR juvenile) AND ("mental health" OR depression OR well-being OR "psychological health" OR anxiety) AND ("randomised controlled trial" OR RCT)

Antall treff reduseres dermed betydelig, samtidig som relevansen øker.

Kortidslagring av PubMed-referanser: Clipboard

Du kan legge til side artikkelreferanser mens du jobber i PubMed:

Hak av de artiklene du vil se nærmere på.
Klikk på Send to.
Klikk på Clipboard.
Artiklene er lagret.

Visuell fremstilling:

Skjermbilde av PubMed med menyknappen 'Send to' markert med rød boks og en valgt artikkel markert med rød sirkel.

Etter at du har lagt over referanser i Clipboard, vil du se antallet rett under søkefeltet. Klikk på det, i vårt eksempel Clipboard (1), og du kommer til dine lagrede referanser.

Visuell fremstilling:

Skjermbilde fra PubMed. 'Clipboard (1)' er markert øverst, og 'Item in Clipboard' vises nederst ved valgt artikkel.

Viktig å vite:
Dette er korttidslagring - med en gang du logger deg ut av maskina, forsvinner referanser fra Clipboard. De ligger der så lenge du er pålogget, og tar du en pause (uten å logge deg av!), så ligger de der i 8 timer.

Bestille artikler fra PubMed som NIH ikke har tilgang til

Alle kan søke i PubMed, men det er ikke alltid du får lest hele artikkelen.

I PubMed får du "ofte" bare tilgang til sammendraget (abstraktet) av en artikkel. NIH abonnerer på mange tidsskrifter, så mye er tilgjengelig – men altså ikke alt. Finner du en relevant artikkel du ikke får åpnet, kan du bestille den via Oria-ikonet i PubMed.

Slik gjør du det:

Når du er inne i artikkelens abstrakt, se etter Oria-ikonet i høyre marg.
Klikk på det.
Klikk på Logg på, og deretter Feide.
Klikk på Bestill dokument.

Som oftest får du artikkelen innen 2–3 dager.

Du får den vanligvis som papirutskrift i en konvolutt med navnet ditt på, som legges i hyllene til venstre for utlånsautomaten i biblioteket. Av og til får du den som PDF via e-post – det avhenger av hva forlaget tillater (kopirettigheter).

Viktig å vite:

Selv om det er gratis for deg, koster én artikkel minst 120 kr for biblioteket. Så vær bevisst: Trenger du virkelig akkurat denne artikkelen?
Husk å være pålogget VPN-klienten om du ikke er på skolen ellers får du ikke lest de artiklene vi har tilgang til.

Cite: Artikkelreferanse fra PubMed til APA-stil

PubMed har en "cite"-funksjon som gir deg PubMed-referansen i APA-stil.

Det er smart å bruke denne, spesielt som bachelorstudent – da slipper du å skrive inn hele referansen manuelt, noe som er ekstra kjekt hvis artikkelen har mange forfattere.

Men: Referansen er ikke helt korrekt, så du må gjøre noen justeringer selv:

Journaltittel: Alle viktige ord (hovedord) skal ha stor forbokstav.
Riktig: Journal of Sports Medicine
Feil: Journal of sports medicine
Artikkeltittel: Bare det første ordet i tittelen og første ord etter kolon (:) skal ha stor forbokstav. (Og på egennavn, selvfølgelig).
Les mer her: https://apastyle.apa.org/style-grammar-guidelines/capitalization
DOI: Du må alltid skrive hele adressen som begynner med https://doi.org/.
Riktig: https://doi.org/10.xxxx/xxxxx
Feil: DOI: 10.xxxx/xxxxx

MeSH Terms (kontrollerte emneord)

Når du søker i PubMed, søker du som sagt i en stor og gratis database med medisinske artikler. For å forklare MeSH-Terms (mesh-emneord), må også Medline nevnes. Medline er den kvalitetssikrede delen av PubMed. Her blir artikler vurdert og tildelt faste emneord, kalt MeSH. Disse emneordene brukes for at du lettere skal finne alle artikler om samme tema i PubMed, selv om forfatterne bruker ulike ord.

Eksempel: Styrketrening

Styrketrening kan beskrives på mange måter, f.eks.: strength training, resistance training, strength exercise eller resistance exercise. Hvis du søker på bare noen av disse ordene, kan du gå glipp av relevante artikler.

Medline har bestemt at alle artikler om styrketrening skal få MeSH-emneordet "resistance training" (uavhengig av hvilke nøkkelord/emneord forskerne har oppgitt).

Når du søker på “resistance training”[MeSH] i PubMed, får du derfor treff på de fleste artiklene som handler om styrketrening, uansett hvilke ord forfatterne har brukt.

Viktig å vite

Nye artikler kan ligge i PubMed i flere uker eller måneder før de får emneord av Medline og først da blir MeSH-emneord og avgrensninger synlige. Hvis du vil være sikker på å få med de nyeste artiklene i trefflista di, bør du kombinere MeSH-emneord og fritekst (forfatternes ord) i samme søk.

Om bruk av [MeSH]

Du trenger ikke å skrive [MeSH] bak et ord for å få treff på artikler som har MeSH-emneord. PubMed gir ofte treff på disse likevel.

Hvis søket ditt skal beskrives i metodedelen av en oppgave, bør du likevel vise hvilke MeSH-emneord du har brukt. Da kan lesere/forskere forstå og gjenta søket ditt.

Eksempler på søk

Søk med bare fritekst:

("resistance training" OR "strength training" OR "strength exercise" OR "resistance exercise")
= 31 760 treff (03.02.26)

Søk med MeSH og fritekst:

("resistance training"[MeSH] OR "resistance training" OR "strength training" OR "strength exercise" OR "resistance exercise")
= 31 760 treff (03.02.26)

Søk med MeSH og mindre fritekst:

("resistance training"[MeSH] OR "strength training" OR "strength exercise" OR "resistance exercise")
= 25 878 treff (03.02.26)

Her, ved det siste eksemplet, får du færre treff fordi PubMed da ikke finner de nyeste artiklene som ennå ikke har fått MeSH-emneord.

Nyttige lenker

MeSH Database https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh/

https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/help/Links to an external site.

https://ntnu-no.libguides.com/PubMedguideLinks to an external site.